SMOOSE
Systemische Analyse von Modulatoren der onkogenen Signalübertragung
Die Onkologie erlebt aktuell einen dramatischen Paradigmenwechsel. Der Erfolg dermolekular zielgerichteten Krebs-Therapeutika in Tumoren mit spezifischen Mutationen hat den mangelnden Fortschritt der konventionellen zytotoxischen Chemotherapie in Frage gestellt. So wurde die personalisierte Medizin Wirklichkeit in der Behandlung von Patienten, veranschaulicht durch die wachsende Anzahl an Tumoren, die sich für einen entsprechenden Ansatz eignen (z.B. EGFR-mutierter Lungenkrebs, BRAF-mutierte Melanome). In den letzten Jahren konnten wir ein Netzwerk für die Entdeckung und Validierung von therapeutisch relevanten Krebsgenomveränderungen etablieren. Außerdem haben wir ein Outreach-Programm initiiert, welches neue Erkenntnisse in dieklinische Routine implementiert. Leider ist jedoch der Erfolg der personalisierten Onkologie durch erworbene Resistenz und Primärresistenz begrenzt, hervorgerufendurch zusätzliche Genom-Veränderungen, die die Reaktionsfähigkeit des Tumors aufdie Therapie modulieren. Das Tempo, in dem die Entwicklung der personalisierten Therapie die klinische Versorgung von Krebspatienten revolutioniert, wird weitgehenddurch die Konvergenz der Genomforschung, Bioinformatik, Zellbiologie, Chemie undStrukturbiologie, strukturbasierte Compound-Entwicklung, molekulare Pathologie und Onkologie angetrieben. Darüber hinaus erfordern die Größe und Komplexität derzugehörigen Datensätze Strategien für die Datenanalyse und Interpretation auf Systemebene. Somit kann nur eine interdisziplinäre Zusammenarbeit verschiedener Disziplinen einen raschen Fortschritt ermöglichen.
Das Ziel des Gesamtverbunds SMOOSE ist es, eine Verbesserung der Qualität der Medizin für Krebspatienten dadurch zu erzielen, das mit Hilfe der Systemmedizin ein umfassender Einblick in die Krankheit und deren Behandlung erfolgt. Im Gegensatz zur isolierten Betrachtung einzelner Komponenten der Krebserkrankung, zielen wir mit unserem Gesamtverbund SMOOSE darauf ab, die komplexen und multifaktoriellen Ursachen von Lungenkrebs und Neuroblastomen zu untersuchen und Modulatoren für die onkogene Signalweiterleitung zu identifizieren. Durch unseren Einsatz von systemorientierten Techniken (Genomsequenzierungen) und durch die multidisziplinäre Zusammenarbeit (von medizinischer Grundlagenforschung über Datenmanagement bis zur Klinischen Studie) ist es das Ziel des Gesamtverbundes die Systemmedizin in Deutschland zu etablieren und den medizinischen Fortschritt voranzutreiben.
Teilprojekte in SMOOSE:
TP 1 Genomische Charakterisierung und Modelierung der Tumorprogression
TP 2 Systems-level modeling of cancer genome evolution
TP 3 Systems-level modeling of mutationally activated signaling networks and response to therapy
TP 4 Data handling, optimization of analysis workflows and applications
TP 5 Identification, validation and exploitation of modulators
TP 6 In vivo characterization of oncogenically rewired signaling networks in lung cancer
TP 7 Modulation of oncogenic signaling through epigenetic writers of the histone code
TP 8 Chemical Biology of multi-pathway inhibition
Keywords: Krebsforschung, Genomforschung, Lungenkrebs, Neuroblastom